Для того, чтобы внести изменения в .msi инсталлятор, открываем .msi-файл программой Orca.
Для примера, я исправлю в инсталлере адрес подключения к серверу приложений и к серверу обновлений.
До изменений эти адреса в инсталляторе выглядят так:
Открываем .msi-файл программой Orca, в блоке слева переходим на Property, в открывшихся свойствах справа находим два свойства APLSERADR и UPDSERADR, меняем их значения и нажимаем сохранить:
После этого закрываем программу Orca, запускаем инсталлятор и видим, что цель достигнута: